La couche d'interopérabilité (IL) est une solution numérique dédiée à l'échange de données entre systèmes pour améliorer la coordination des soins et les rapports. Elle inclut un module de configuration des canaux pour supporter différentes normes. Actuellement, l'IL englobe sept systèmes au Kenya, tels que Text for Adherence (T4A) pour le suivi de l'adhésion aux ARV par SMS/USSD, Ushauri pour la gestion de rendez-vous, le Web Antiretroviral Dispensing Tool (Web ADT), et mLab qui transmet les résultats de laboratoire par SMS. De plus, elle s'intègre aux systèmes DHIS2, IQCare et KenyaEMR, renforçant ainsi la qualité des soins et le suivi des patients, notamment dans les domaines de la santé maternelle et infantile ainsi que pour les maladies transmissibles.