Le Malawi fait face chaque année à des urgences de santé publique, illustrées par le cyclone Idai en mars 2019, qui a impacté plus de 922 900 personnes et en a déplacé 86 000. La Direction de la gestion des affaires de catastrophe (DoDMA) a orchestré la réponse initiale et réalisé une évaluation post-catastrophe, qui a exposé des lacunes dans la surveillance sanitaire avant l'événement. Bien que la surveillance se soit améliorée pendant l'intervention, des insuffisances demeurent. Des recommandations sont faites pour renforcer la coordination, la supervision et les systèmes d'alerte précoce. Le système intégré de surveillance des maladies et de réaction (IDSR) a été mis en place, avec des efforts pour optimiser les rapports hebdomadaires via le DHIS2. De plus, la plateforme de surveillance One Health (OHSP), lancée en 2019, vise à améliorer la surveillance en temps réel, soutenue par plusieurs organisations et adaptée pour répondre à la crise du COVID-19. Les domaines prioritaires de santé inclus sont variés.