L'objectif du programme est d'assurer un suivi en temps réel des performances à travers des rapports hebdomadaires destinés aux partenaires de mise en œuvre, au ministère de la santé, ainsi qu'aux partenaires de développement et aux donateurs. Un système a été développé pour améliorer le suivi et l'évaluation (S&E) ainsi que l'assurance qualité du programme KP/PrEP. Actuellement en phase de mise en œuvre, son extension à tous les partenaires de mise en œuvre est envisagée. Les domaines de santé concernés incluent les maladies transmissibles.