El departamento de Laboratorio Médico ha implantado un sistema diseñado para mejorar la eficiencia agilizando los procesos de laboratorio y facturación, garantizando unos servicios de laboratorio precisos y puntuales, mejorando la gestión de los datos de los pacientes, aumentando los ingresos y reduciendo los costes. Alrededor de 10 usuarios manejan este sistema, que incorpora diversas funciones como la gestión de pacientes, la gestión de muestras de laboratorio, la elaboración de informes, la facturación, la gestión de seguros médicos, la gestión de citas y el intercambio de datos con el sistema de contabilidad general de la organización. La configuración emplea OpenSuse Linux para el servidor, Microsoft Windows 7/10 para los equipos cliente, PostgreSQL para la base de datos y Tryton-ERP. Las áreas de interés sanitario del laboratorio incluyen la salud sexual y reproductiva, la salud maternoinfantil, la promoción de la salud, las enfermedades transmisibles, las enfermedades no transmisibles (ENT), el cáncer y la salud bucodental.